MBR内微生物生长分为有机大分子物质吸附膜组件阶段、初期粘附阶段、群集生物生长阶段和形成生物膜四个阶段，鉴于此，膜污染过程一般可分为三个阶段：阶段：初始污染阶段。这一阶段的污染是不可避免的。污染的引起主要是由于膜材料与污泥混合液中污染物的相互作用而引起的。第二阶段：缓慢污染阶段。这一阶段主要与运行通量的选择有关，在临界通量下运行。这一阶段主要是由于污泥混合液中的溶解性物质，胶体物质引起的。第三阶段：快速污染阶段。污染受膜通量的影响，在超临界通量下运行，污泥在膜表面有沉积;这一阶段产生可能的原因主要有两方面，一是膜孔堵塞造成实际通量大于临界通量;或者是由于膜组件通量的不均匀性，使得局部通量大于临界通量。
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