在生物反应塔的进气口,一定量的空气被注入含有硫化氢的沼气中,混合气体直接进入生物脱硫塔穿过填料床层,生物反应塔中的特制填料,为脱硫细菌的生长繁殖提供了充分的空间。营养液的循环使填料保持潮湿状态,并且补充脱硫细菌生长繁殖所需的营养。专属脱硫细菌(如丝硫菌属或者硫杆菌属),获得营养成分后开始在填料表面生长繁殖。沼气中的硫化氢被填料表面的微生物吸收并催化转化生成元素硫,进而转换成硫酸,生成的硫酸定时或定pH 排出系统,此过程周而复始,实现脱硫过程。
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