明渠式紫外线消毒原理是一用紫外线光子的高能波段的能量破坏水体中的各种病毒、细菌、病原体的DA和RA结构，使其受破坏后丧失生产蛋白质的能力和繁殖能力，从而达到目的。紫外线是一个物理过程，其对微生物的遗传物质DA或RA的直接作用几乎不具有限制性，先已知的致病微生物都能快速被紫外线杀灭，可见紫外线是广谱的消毒技术之一。
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